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Elsevier
與我們共同出版
Article

2021 Reaxys 獎

2024年1月8日

今年(2021 年)Elsevier 特別與國立臺灣大學化學系合作,舉辦 NTU Reaxys Award,鼓勵年輕化學家的創新研究,並分享 Reaxys 如何支持他們的學習與研究。 本次 NTU Reaxys Award 得獎者陳江昀與許哲維,兩位皆是博士應屆畢業生。恭喜他們獲得殊榮,實至名歸,以下為兩位得獎者的簡介以及 Reaxys 的使用心得分享。

陳江昀博士 Dr. Chiang-Yun Chen

Education
  • Ph.D. (2016–2021) in Chemistry, National Taiwan University (NTU)

  • Ph.D. Thesis: Synthesis of Azido-Globo H Analogs for Immunogenicity Evaluation

Advisors:
  • Dr. Chung-Yi Wu, Professor of Genomics Research Center, Academia Sinica.

  • Dr. Chi-Huey Wong, Distinguished Chair Professor of Department of Chemistry, NTU.

Publications
  • Chen, C. Y.; Lin, Y. W.; Wang, S. W.; Lin, Y. C.; Cheng, Y. Y.; Ren, C. C.; Wong, C.H.; Wu, C. Y. Synthesis of Azido-Globo H Analogs for Immunogenicity.  (under revised)

  • Mettu, R.; Chen, C. Y. (co-first); Wu, C. Y. Synthetic carbohydrate-based vaccines: challenges and opportunities. J. Biomed. Sci. 2020, 27, 9.

Honors
  • AS-TIGP Research Performance Fellowships Award, 2021.

  • CBMB Oral Presentation Awards, 2020.

  • IBC/IBS-CUHK symposium, poster award, 2019.

  • 29th International Carbohydrate Symposium, Young Research Workshop Presentation, 2018.

  • TIGP Student Conference Travel Grant, 2018.

Reaxys 帶給我的助益-陳江昀博士

我做的研究主要是關於醣類的化學及酵素合成 ,而這些醣類分子有許多羥基,為了將單醣分子以有機合成的方式合成為寡醣,這些醣分子上的羥基需要有特殊的保護基保護以確保再進行寡醣合成時可以得到我們想要的區域選擇性(Regioselectivity)與立體選擇性(Stereoselectivity),如何選擇這些保護基需要大量的經驗,而這正是剛攻讀博士班時的我所缺乏的,有了 Reaxys 的幫助讓我在經驗還不豐富的時候可以做到以下幾點:

  1. 藉由 Reaxys 可以得知不同的研究在 處理每個反應時的細節以及如何純化 ,互相比較後而得到一個適合自己操作的方式。

  2. 藉由 Reaxys可以得知先前的研究是 選用怎樣的保護基 來保護 特定單醣以及特定位置的羥基。

  3. 為了合成有特定區域選擇性與立體選擇性的寡糖,Reaxys 可以幫助我判斷 我應該選用哪些適當的保護基來達成我的目標。

在我稍微有了經驗之後 Reaxys 更可以幫助我以下的目標:

  1. 檢測我設計的化合物合成路徑 ,是否有更便捷的路徑可以達到。

  2. 檢測路徑中的每一個反應 ,是否有更高產率的做法或是更容易取得的試劑來增加整體研究的效率以及研究的經費。

  3. 如果是合成新的化合物, Reaxys 也能提供我先前的研究中相似的化合物或相似的反應是如何製備以及純化 。

最後,在合成完成或是撰寫論文時 Reaxys 也能提供我以下幫助:

  1. 比較先前研究中特定化合物的 NMR 光譜是否和我自己合成的化合物一致。

  2. 比較特定化合物在先前的研究中是如何被合成,在論文中探討各種方法的優缺點以及和自己的方法進行比較。

  3. 快速的查詢到那些特定化合物在先前的研究中已經被合成過 ,並在論文中加以引用。

在合成的研究中 Reaxys 對我非常有助益,不管是合成路徑的規劃,化合物的製備及純化以及最後的分析和文章撰寫, Reaxys 都提供我非常大的幫助,相信在往後的研究我也會繼續使用 Reaxys 來繼續增加研究的效率!

許哲維博士 Dr. Tse-Wei Hsu

Education
  • Ph.D. (2016–2021) in Chemistry, National Taiwan University (NTU)

  • Ph.D. Thesis: Using molecular sensors for probing bacterial transglycosylation and maltosyltransfer

  • Advisor: Dr. Jim-Min Fang, Professor of Department of Chemistry, NTU.

Publications
  • Tse-Wei Hsu, Jim-Min Fang “Effective Assay of Bacterial Transglycosylation by Molecular Turn-On Sensing and Secondary-Order Scattering Effect” Analyst 2021, DOI: 10.1039/D1AN00941A. (first author)

  • Tse-Wei Hsu, Hsin-Chuan Hsu, Hsin-Yu Chan, Jim-Min Fang “A terpyridine zinc complex for selective detection of lipid pyrophosphates: a model system for monitoring bacterial O- and N-transglycosylations” J. Org. Chem. 2020, 85, 12747–12753. (first author)

  • Wei-Li Lee, Tse-Wei Hsu, Wei-Cheng Hung, Jim-Min Fang “A copper(II)–dipicolylamine–coumarin sensor for maltosyltransferase assay” Dalton Trans. 2019, 48, 8026–8029. (co-first author)

Honors
  • Dean's Award of College of Science, NTU, 2021.

  • Scholarship of Eternal Materials Co., Ltd (30,000 NTD), Eternal Materials Co., Ltd, 2020.

  • The Best Poster Award of 2020 TBF seminar (10,000 NTD), A Model System for Monitoring Bacterial O- and N Transglycosylations using Terpyridine-Zn Complex with Fluorescent and Scattering Effects. Taiwan Bio-development Foundation, Taipei, Taiwan, 2020.

  • Excellent teaching assistant, School of Medicine, NTU, 2019.

  • Scholarship of Gao Ying-Shi Chinese Culture Collection Educational Foundation (60,000 NTD), Eternal Materials Co., Ltd, 2019.

  • Excellent Poster Award, Probing Bacterial Transglycosylation with Terpyridine Derived Sensor. The 13th International Symposium on Organic Reactions (ISOR-13), Hsinchu, Taiwan, 2018.

  • Academic Excellence Award × 2, Department of Applied Chemistry, NCYU.

  • Excellent award, Fundamental Science Competition in Chemistry, NCYU.

Reaxys 在我近十年研究中扮演的角色-許哲維博士

Reaxys 對我近十年的研究生涯中扮演著極為重要的角色,舉凡小分子搜尋、合成方法、合成路徑規劃、物化性整理 以及文獻搜索等,Reaxys 可說是化學界研究的好夥伴及好麻吉。本人首次接觸 Reaxys 大約在大二,那個時候 Reaxys 剛成立沒幾年,類似的資料庫還沒有很完備。舊版操作介面在首次使用上就有不錯的印象,在我專題研究時就有著很大的幫助及樂趣。研究生時期本人算是 Reaxys 的重度使用者,碩博班時期的研究主要是天然物全合成 Total synthesis 以及分子檢測 Molecular recognition 等領域,時常需要找類似的合成方法以及複雜分子的合成。 Reaxys 幾乎都可以滿足我的需求,不管在單一化合物合成的方法或是延伸物的製備、生物特性、物理性質等整理(圖 1),甚至於可購買的來源等,在研究過程中可省去搜尋的大量時間。

圖 1. Reaxys 針對單一化合物(以 COVID 19 藥物 Remdesivir 為例)可彙整出光譜(Spectra)、生物特性(Bioactivity)、物理性質(Physical data)、製備方式(Preparations)、相關反應(Reactions)以及文獻(Documents)等資訊。

Reaxys 令我最滿意的功能是可以依照反應種類、催化劑、溶劑及產率等作篩選,且篩選結果皆有文獻附註,在文章發表上有著莫大的助益 也十分的人性化(圖 2)。我也利用過 Reaxys 的合成計畫分析,透過樹狀圖可以讓使用者一目了然的去整理化合物的合成路徑(圖 3)。且起始物搜索可直接從 ChemDraw 複製結構或化學式,可節省繪製結構的時間。

圖 2. Reaxys 對於單一化合物的合成資訊頁面可直接看到反應條件、產率以及文獻等資訊。條件部分可以透過左側的選單篩選。

圖 3. 點選化合物資訊欄最右邊功能,可利用樹狀圖進行單一化合物的合成路徑規劃,並瀏覽每一步驟的詳細資訊以及文獻彙整。

Reaxys 是一個非常方便的資料庫,在我的研究生涯中扮演著極為重要的角色,也省去了很多文獻搜索的時間。以站在巨人的肩膀上的角度,如果後續有什麼願望清單,本人會希望 Reaxys 在新化學反應的部分可引進 AI 的預測,或是運用 AI 進行合成路徑的模擬。目前知悉 Elsevier 有推出最新「Reaxys PAI」的合成路徑預測工具, 真心希望 Reaxys 可使合成化學提升至更高的層次,讓使用者有著不一樣的研究體驗。